云南财经大学财税系于2020年7月成立，由原来的财政系和税收系合并而成，下辖财政学和税收学两个专业，财政学专业为首批国家级一流本科专业建设点、税收学专业为首批省级一流本科专业建设点。财政学专业始建于1979年，是云南省最早建立的财政学本科专业，税收学专业始建于1987年，也是云南省最早建立的税收学专业。财政学（含：税收学）专业2000年获得了硕士学位授予权，2013年获得应用经济学博士学位授予权，并开始招收财政学博士，2015年开始招收财政学博士后，即于2015年开始形成了覆盖“本科-硕士-博士-博士后”完整的普通高等教育学科专业体系。
财税系拥有一支高水平的师资队伍。现有专职教师31名，教授11名、副教授14名，高职比例达80.5%，博士生导师4名、博士后6人，拥有博士研究生学历教师18名、占58.1%。拥有1名国家“万人计划”哲学社会科学领军人才，1名中宣部2017文化名家暨“四个一批”人才，1名国家百千万人才工程、云南省首批“云岭学者”、“有突出贡献中青年专家”等称号获得者，1名享受“国务院政府特殊津贴”获得者，1名云南省师德标兵、1名“云南省政府特殊津贴”获得者，1名云南省万人计划“青年拔尖人才”。
财税系教师团队围绕财税理论与政策、公共政策与政府治理等开展学术研究，取得了一系列重要学术成果。主持各项科研课题100余项，其中国家自然科学基金重点项目1项、国家社科基金重大项目1项、教育部哲学社会科学重大课题攻关项目1项、15项国家自然科学基金一般项目和地区科学基金项目、6项国家社科基金项目，完成国务院委托项目2项，财政部、国家税务总局、教育部等中央部委决策咨询项目10余项，云南省财政厅、云南省税务局、云南省机构编制管理委员会、云南省金融办、云南省商务厅等省级决策咨询项目50余项，云南省各州（市）、县（市、区）等委托项目100余项。在《经济研究》、《经济学动态》、《财贸经济》、《经济学（季刊）》、《财政研究》、《中国行政管理》、《金融经济研究》（日本）等国内外重要学术刊物上发表论文100余篇，其中：在经济学顶级期刊《经济研究》上发表论文7篇，被《新华文摘》全文转载1篇。在中国社会科学出版社、中国财政经济出版社、中国文献出版社、云南大学出版社等出版学术专著10余部。
